Ingénieur·e de recherche en radiobiologie et biologie des cancers à ANTICIPE

Présentation de l'unité d'affectation :

L’Unité Inserm U1086 développe des recherches fondamentales et appliquées portant sur les déterminants individuels et collectifs de la survenue des cancers et de leur évolution. Elle réunit 96 personnes, chercheurs, enseignants chercheurs et praticiens hospitaliers, ingénieurs et techniciens de disciplines différentes allant de la biologie à la santé publique de l’Université de Caen Normandie, du CHU de Caen, du CLCC François Baclesse et de l’Inserm. Elle s’appuie sur des grandes bases de données biologiques et épidémiologiques : cohorte de population générale (AGRICAN, plus grande cohorte mondiale développée en milieu agricole), registres de cancer, une collection de ressources biologiques sur les cancers de l’ovaire (CRB bioREVA), ainsi que sur des outils méthodologiques originaux et des plateformes technologiques et méthodologiques pour certaines labellisées au niveau national [plateforme « Cancer et Cognition », plateforme de géographie MAPinMED (label IBiSA), ImpedanCELL (activité cellulaire en temps réel à haut débit, label IBiSA), ORGAPRED (label IBiSA et certifiée ISO-9001), Virtual’His (histo-imagerie quantitative) et IsoCELL (cytométrie en flux)], désormais intégrées au sein de l’Unité de Services PLATON et à la Structure Fédérative Normandie Oncologie.

Les résultats de nos travaux permettent en particulier d’évaluer l’impact des pesticides sur le risque de cancers en milieu agricole, d’améliorer l’efficacité et l’équité du dépistage des cancers du côlon-rectum et du sein, de proposer la prévention des troubles cognitifs liés aux traitements des cancers, et d’améliorer la prise en charge thérapeutique des femmes atteintes d’un cancer de l’ovaire. Ils proposent aussi des programmes permettant de réduire les inégalités sociales et territoriales dans la prévention et le traitement des cancers.

L’équipe de l’axe BioTICLA (« Médecine de précision des cancers de l’ovaire ») dans laquelle sera réalisé ce projet, dirigée par le Dr. Laurent Poulain, est reconnue sur le plan national et international pour ses travaux sur les cancers de l’ovaire, sa capacité à faire interagir cliniciens et chercheurs et à mettre en place des études cliniques translationnelles. Elle travaille ainsi sur :

• la mise en place d’outils d’aide à la décision thérapeutique, à la fois par la recherche de biomarqueurs prédictifs et/ou pronostiques et par le développement de tests fonctionnels prédictifs (en particulier via l’utilisation d’organoïdes tumoraux ou Patient-Derived Tumor Organoids (PDTO) ;

• le développement de stratégies thérapeutiques innovantes, en participant à des études de drug design, en recherchant de nouvelles cibles thérapeutiques et en évaluant l’intérêt de diverses stratégies combinatoires. Son expertise sur les PDTO de cancer de l’ovaire a mené au développement de la plateforme ORGAPRED et à l’élargissement de son expertise à d’autres localisations tumorales, en particulier aux tumeurs des voies aéro-digestives supérieures (VADS), pour lesquelles elle mène des travaux translationnels visant à développer des nouvelles stratégies thérapeutiques innovantes et identifier les patients qui pourraient en bénéficier.
  

Lieu de travail :

Bâtiment de recherche, Centre de Lutte Contre le Cancer François Baclesse.

Positionnement hiérarchique :

L’ingénieur·e de recherche travaillera sous la supervision de Louis-Bastien Weiswald, chercheur au CLCC F. Baclesse, et de Marion Perréard, chirurgienne ORL au CHU de Caen.

 

Missions principales du poste :

Un poste d’ingénieur·e de recherche (H/F) est ouvert au sein de l’unité Inserm U1086 ANTICIPE pour contribuer au développement d’approches fonctionnelles innovantes visant à prédire la sensibilité des carcinomes épidermoïdes des voies aérodigestives supérieures (VADS) aux irradiations par rayons X et par ions carbone. Le contrat devra débuter au plus tard le 1er mars 2026.

Le ou la candidate prendra part à l'étude de la radiorésistance tumorale en exploitant les organoïdes dérivés de tumeurs de patients (PDTO), des modèles 3D particulièrement pertinents pour l’évaluation de nouvelles stratégies thérapeutiques. Il/elle mènera les expérimentations permettant de comparer la réponse des PDTO aux différents types d’irradiation, en mobilisant des approches avancées de culture 3D, d’imagerie quantitative, de tests fonctionnels miniaturisés et en lien étroit avec les analyses transcriptomiques et génétiques disponibles.

Le projet TUMIC CARE vise à comprendre comment les tumeurs réagissent différentiellement aux différents types de radiations et à identifier les conditions permettant, à terme, de prédire la sensibilité individuelle aux ions carbone, dans une perspective de médecine personnalisée. Le ou la candidate bénéficiera d’un environnement d’excellence combinant biologie tumorale, radiobiologie et technologies de pointe. Il/elle travaillera au cœur d’un consortium pluridisciplinaire réunissant l’unité Inserm U1086 ANTICIPE, la plateforme ORGAPRED (Unité de Services PLATON), le Laboratoire de physique corpusculaire (LPC, CNRS UMR 6534), le GANIL, l’UMR CNRS 6252 (Centre de recherche sur les Ions les Matériaux et la Photonique, équipe ARIA), offrant un accès privilégié à des équipements uniques : trieur large particules, automates de culture et d’évaluation de la réponse de PDTO, imagerie 3D ultrarapide, irradiateur X et faisceaux d’ions carbone du Ganil.

Activités et tâches du poste :

• Mettre en culture, maintenir et caractériser des PDTO : décongélation, expansion, contrôle de qualité.

• Établir et optimiser des cultures de PDTO issues de biopsies, dans le cadre du protocole clinique ORGAVADS (NCT04261192), en prenant en compte les contraintes de faible matériel biologique.

• Préparer les PDTO pour les irradiations : standardisation des conditions expérimentales, calcul des doses, préparation logistique des sessions RX et ions carbone.

• Réaliser les irradiations aux rayons X au sein du laboratoire, et coordonner les irradiations aux ions carbone en lien avec les équipes du CIMAP et ORGAPRED.

• Mettre en œuvre les tests fonctionnels d’évaluation de la réponse aux traitements : viabilité, stress oxydatif, prolifération, clonogénicité (test de formation d’organoïdes), cytotoxicité, imagerie 3D.

• Utiliser le trieur large particule afin de développer des protocoles miniaturisés nécessitant un très faible nombre de PDTO par condition.

• Concevoir et optimiser des protocoles expérimentaux innovants permettant la comparaison RX/ions carbone dans des conditions standardisées et reproductibles.

• Analyser quantitativement les données expérimentales : courbes dose-réponse, indices de radiorésistance, IC50, segmentation 3D, extraction de paramètres morphologiques et fonctionnels.

• Participer aux réunions de projet, analyses d’avancement et discussions scientifiques au sein du consortium (ANTICIPE – ORGAPRED – ARIA/CIMAP – LPC – GANIL).

• Participer à la valorisation scientifique : rédaction d’articles, présentations dans des congrès, encadrement ponctuel d’étudiants.

Conditions particulières d'exercice :

• Travail en environnement biologique sécurisé (culture cellulaire)

• Manipulation ponctuelle d’échantillons irradiés

• Présence occasionnelle en soirée, nuit ou week-end selon les créneaux d’irradiation